Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR4

FAM19A4, Protein FAM19A4, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM19A4Q96LR4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM19A4Q96LR4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms