Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EME1Q96AY2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EME1Q96AY2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EME1Q96AY2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EME1Q96AY2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EME1Q96AY2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EME1Q96AY2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
EME1Q96AY2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EME1Q96AY2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EME1Q96AY2 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EME1Q96AY2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EME1Q96AY2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms