Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms