Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD6Q92537 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms