Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIEQ8NEW7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms