Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CSNK2A3Q8NEV1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CSNK2A3Q8NEV1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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