Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms