Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms