Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms