Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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MED27Q6P2C8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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MED27Q6P2C8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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