Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.4 ms