Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LETM2Q2VYF4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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