Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms