Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PDK4Q16654 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PDK4Q16654 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
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PDK4Q16654 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PDK4Q16654 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PDK4Q16654 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PDK4Q16654 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PDK4Q16654 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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