Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms