Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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