Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms