Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms