Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SEC23BQ15437 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SEC23BQ15437 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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