Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERV3-1Q14264 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms