Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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