Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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GTF2H3Q13889 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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GTF2H3Q13889 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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GTF2H3Q13889 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GTF2H3Q13889 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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