Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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SHROOM2Q13796 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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SHROOM2Q13796 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHROOM2Q13796 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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