Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RUNX3Q13761 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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