Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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