Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TOP3AQ13472 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TOP3AQ13472 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TOP3AQ13472 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TOP3AQ13472 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TOP3AQ13472 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TOP3AQ13472 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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