Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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NME3Q13232 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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NME3Q13232 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME3Q13232 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME3Q13232 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME3Q13232 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME3Q13232 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NME3Q13232 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME3Q13232 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME3Q13232 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME3Q13232 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NME3Q13232 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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NME3Q13232 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME3Q13232 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME3Q13232 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME3Q13232 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NME3Q13232 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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NME3Q13232 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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