Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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GRIK2Q13002 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK2Q13002 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GRIK2Q13002 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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