Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF2Q12947 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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