Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCB1Q12824 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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