Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC173Q0VFZ6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms