Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms