Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms