Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP1Q04837 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms