Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RELAQ04206 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RELAQ04206 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RELAQ04206 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RELAQ04206 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RELAQ04206 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms