Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms