Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH6A1Q02252 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms