Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTTPP55157 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTTPP55157 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTTPP55157 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
MTTPP55157 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
MTTPP55157 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
MTTPP55157 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms