Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPAP53621 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPAP53621 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPAP53621 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms