Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTF2A1P52655 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms