Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNA2P51530 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNA2P51530 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNA2P51530 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms