Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERFP50548 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERFP50548 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms