Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD97P48960 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD97P48960 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD97P48960 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms