Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDH1P40925 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDH1P40925 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDH1P40925 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MDH1P40925 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDH1P40925 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MDH1P40925 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MDH1P40925 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MDH1P40925 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms