Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETFBP38117 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFBP38117 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFBP38117 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFBP38117 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFBP38117 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFBP38117 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFBP38117 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFBP38117 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETFBP38117 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms