Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP5C1P36542 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms