Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTGER1P34995 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTGER1P34995 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTGER1P34995 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms