Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA1P29973 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms