Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM5AP29375 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM5AP29375 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms