Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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PTPRMP28827 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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PTPRMP28827 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRMP28827 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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